耐药性伤寒在非洲和亚洲成为一种流行病

世界正面临着多重耐药性伤寒的流行。 这是迄今为止最大规模的细菌基因组研究的结论,该细菌引起肠道沙门氏菌( Tymonella enterica Typhi)。 根据研究人员的说法,这种经常被多重耐药的细菌克隆,称为H58,正在亚洲和非洲蔓延。 他们警告说,它的传播可能会增加治疗费用并导致更多的并发症。

“现在有一种紧迫感,”英国Hinxton的Wellcome Trust Sanger研究所的遗传学家Gordon Dougan说,他是该论文的作者。

伤寒通过受污染的水或食物传播,引起发烧,头痛和其他症状。 如果不治疗,该疾病可导致胃肠穿孔等并发症,并可杀死多达20%的患者。 估计每年的病例范围从1000万到3000万。 大约有20万人死亡。 耐多种抗生素的S. enterica Typhi最早出现于20世纪70年代。 但H58对科学家来说尤其令人担忧,因为它在越来越多的国家出现。

为了概述其传播,科学家分析了来自亚洲,非洲和大洋洲21个国家的1832个样本的基因组。 杜根说,这种克隆可能在1985年左右出现在南亚,然后在接下来的几年中逐渐获得抗性基因,然后传播到东南亚和非洲。

作者在今天的“ 自然遗传学”杂志网络版上报道说,在非洲, 并且从那里传播到南方。 在上个月PLOS被忽视热带病的一篇论文中,Dougan和其他科学家在马拉维的一家医院 。 从1998年到2010年,该医院平均每年诊断出14例伤寒。 大约7%的分离株对多种药物有抗药性。 2014年有782例诊断,97%具有多药耐药性。 “一旦到达你的国家,你就必须转向更昂贵的抗菌药物,”杜根说。

目前尚不清楚H58为何如此成功。 一个可能的解释是:克隆可能已经发生突变,可以更好地在传播疾病的携带者组织中存活,而不会自己生病。 Dougan说,H58中存在一些可能指向的遗传变化。 “但这是猜测,”他警告说。 英国华威大学的微生物学家Mark Achtman说,为什么某些细菌克隆成为优势仍然是个谜。 “这是我们在不同的细菌中一次又一次地看到的现象,而且从未被人理解过。”

Achtman说,该论文是任何人发表的最大的细菌基因组样本之一。 他说,人们对H58传播已经了解很多。 “但这是我们第一次对伤寒沙门氏菌和伤寒沙门氏菌组织进行了如此详尽的概述。”Dougan说,他和他的同事正在对更多的伤寒分离株进行测序,以确定H58的起源。